Nach ihrer abenteuerlichen Jagd nach den Clow-Cards hofft Sakura Kinomoto nun auf ein friedliches weiteres Schulleben, als sie auf die Mittelschule kommt. Sie trifft viele Freunde wieder, auch Shaoran Li ist zurückgekehrt und geht mit ihr auf die gleiche Schule. Doch dann bemerkt sie, dass ihre Clow-Cards allesamt leer geworden sind. Bei Yukito Tsukishiro, dem zweiten Wächter der Karten, machen sie die gleiche Entdeckung und bemerken, dass die Karten auch ihre Magie verloren haben. Nur Sakura selbst ist davon nicht betroffen. In einem Traum erhält sie einen neuen Schlüssel und begegnet einer geheimnisvollen Person, die über der Stadt schwebt. Der Schlüssel ist am nächsten Morgen real, und so macht sie sich mit ihren Freunden auf, das neue Rätsel der Karten zu lösen.